ALM2Thunderbirdをご利用頂きありがとうございます。フィードバックを頂きましたのでコメントをします。

ALM2Thunderbirdの現在の実装では、SubjectヘッダーはAL-Mailの保存形式のままにしています。本来ならALM2Thunderbirdでエンコードしなおすべきなのですが、Thunderbirdに任せています(^^;)Thunderbirdにてフォルダーのエンコード形式を変更することで表示可能な場合があります。

現時点ではこちらは仕様となります。ご了承下さい。